年1月21日，深圳大学医学部基础医学院陈心春教授在JournalofExperimentalMedicine发表了题为Single-cellimmuneprofilingrevealsfunctionaldiversityofTcellsintuberculouspleuraleffusion研究成果，利用结核性胸腔积液为模型，通过单细胞测序技术揭示了结核菌感染组织中人T细胞功能的多样性以及感染组织中TCR特异性扩增。百奥智汇参与了该研究中的单细胞数据分析工作。
结核病是由结核分枝杆菌（Mtb）感染引起的慢性重大传染病。我国是全球结核病高负担第三国家。由于没有有效预防性疫苗，当前的结核病防控策略主要依靠早期发现和治疗活动性结核病（传染源）。T细胞在宿主抗结核感染免疫中发挥着至关重要的作用。此前大多数对人结核病研究都是基于对外周血细胞的分析，这无法准确反映感染部位发生的结核菌特异性免疫反应。结核性胸膜炎（TPE）是由结核菌感染引起的一种胸膜性疾病，其主要的特点是白细胞流入胸膜腔，胸水中存在大量的T淋巴细胞，这为研究结核菌感染组织中T细胞的特异性反应及其复杂性提供了一个非常好的模型。
作者收集了TPE患者新鲜的胸水和配对的血液样本，应用scRNA-seq和scTCR-seq数据将转录状态与抗原特异性相关联，模拟了T细胞群的克隆扩增，并研究了不同背景下的T细胞表型可塑性。确定了25个具有不同组织分布模式的独特T细胞亚群，并确定了这些亚群的连接性和潜在的发育路径。作者发现在结核性胸膜炎病人胸水中存在一群表达GZMA,KLRB1,GZMA和PRF1的CD4CTL细胞，并进一步利用流式细胞术确定了这群细胞在胸水中显著增高，谱系追踪显示这群CD4CTL细胞和Th1细胞之间可以相互转化。在CD8T细胞中发现了表达GZMK，根据轨迹和TCR谱系分析，这群细胞具有较强的细胞*性。体外实验也证实了，GZMK对结核菌感染的巨噬细胞具有细胞*性和杀菌活性。GZMK表达的CD8T细胞在TPE的胸膜液中显著富集和特异克隆性扩增，可能代表一种活跃的组织特异性效应机制，介导组织炎症，并为结核菌感染部位GZMBCD8T细胞减少提供支持。这些结果表明它们在结核菌感染组织中具有重要的作用，这些结核菌感染诱导的特异TCR可能为后续开发TCR-T治疗结核病提供了重要的参考，并有助于进一步发现新的抗原用于结核疫苗的研发。深圳大学医学部基础医学院蔡毅、汪业*、史琛彦为该论文的并列第一作者。深圳大学医学部基础医学院陈心春教授与CarlG.Feng为该论文的共同通讯作者，获得国家自然科学基金的支持。
图1课题研究方案
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