广州医院；上海交通大医院呼吸与危重症医学科
罗文婷，陈盼，李庆云，丁永杰，陈若可，郑劲平
呼吸系统疾病是人类常见的疾病,其具有较高的发病率和病死率,影响人类的健康和降低患者的生活质量。临床患者的生物样本是疾病研究的基础,生物样本库的发展将促进疾病的研究。通过有效途径实现生物样本和数据资源共享是提高科研研究效率的关键。本文阐述了资源共享平台的开发与应用,包括平台构建背景、门户网站和移动终端的简介、平台的数据架构、安全的管控措施、共享的伦理机制,以及如何利用平台实现资源共享、平台应用的方向和预计达成的目标等。开展呼吸疾病领域的资源共享服务,以期吸引更多单位的交流与合作,共同为呼吸疾病诊疗与研究领域做出贡献。
呼吸系统疾病；生物样本库；资源共享平台；开放
呼吸系统疾病以COPD、支气管哮喘等疾病为代表,因其危害性、持久性、反复性而与心脑血管疾病和恶性肿瘤等被共同列为四大慢病之一。研究显示,我国COPD患者人数约为1亿人,患病人数急剧增加,而且病死率较高,已经构成我国重大疾病负担,防治形势严峻。临床患者的生物样本是疾病研究的基础,通过对患者的样本进行疾病生物标志物的研究,分析疾病的发病机制,促进基础研究与临床相结合,最终达到改善疾病诊治和预防的目的。但在我国卫生信息建设体系中,特别是医疗系统信息化建设方面,存在着数据分散、标准不一、质量欠佳等各种问题,造成大数据难以整合、资源难以共享的局面。
国外的一些研究机构首先探讨了打破这种局面的理论和方法,其中包括对共享方式的研究、生物样本库建设现状的分析、国家在共享层面的*策支持、期望实现的共享前景等,对资源共享起到一定的推进作用。相对于国外研究现状,国内的研究主要停留在对已有的成果解析,缺乏深入分析和自主创新。根据我国目前相关法制建设、临床研究资源管理现状,借鉴国外共享法律规范和理论成果,建立中国临床研究资源共享平台具有理论上、技术上和实践上的可行性。
因此,通过建立呼吸疾病生物样本库资源共享平台(以下简称“共享平台”),对呼吸疾病捐献者的样本资源及其临床信息进行采集、处理、保藏、质控和应用,平台面向医疗人员和科研人员开放,为已注册的研究者提供浏览、检索与申请合作等基本功能,并不断优化,旨在为推动呼吸疾病诊疗规范化进程做出贡献。
1共享平台构建的基础与定位
1.1呼吸疾病生物样本实体库呼吸疾病生物样本库依托国家呼吸系统疾病临床医学研究中心于年开始建设,已具备超低温冰箱存储区、液氮存储区、自动化样本处理设备、预处理室、实验室及配套设施,并配备完善的监控程序,保障样本库的正常运转。本样本库以保藏呼吸系统疾病生物样本资源为主,涵盖的疾病种类主要有COPD、支气管哮喘与过敏免疫性疾病、呼吸系统感染、肺部肿瘤等。保藏的生物样本有常规样本,如血液、尿液、粪便、手术病理组织等,也收集呼吸疾病特有的一些样本,如痰液(包括诱导痰)、肺泡灌洗液、胸腔积液、咽拭子浸液等,并建立了严格的管理制度和标准操作流程。目前广州医院生物样本库实体库已收集超过万份的生物样本资源,随着样本库的发展,样本资源的存储能力也将不断扩大。
1.2呼吸疾病生物样本信息数据库生物样本保藏的全过程包括采集、运输、接收、制备、储存、出库、销毁等相关信息和数据由培训上岗的工作人员通过规范化建设的样本信息管理系统登记和管理,系统拥有一套统一的编码规则,能够保证样本条码的唯一性和可追溯性。医院信息系统、实验室信息系统、医学影像系统和电子病历系统等实现数据对接,为生物样本后续使用提供更加完善的临床信息。在此基础上,开发建设信息统一管理和共享网络化的资源共享平台,共享数据脱敏后上传展示,并针对不同访问权限的用户开放相应等级的数据范畴,研究者亦可通过检索查询等方式获取所需的资源,医院临床科室间、跨医院、跨地区的样本库资源共享服务。
1.3共享平台的建设体系平台依托于国家呼吸系统疾病临床医学研究中心组织架构体系建设,根据呼吸系统疾病生物样本库管理标准规范流程对捐献者各种生物样本(如血清、血浆、血细胞、上下呼吸道分泌物、支气管和肺组织、肺泡灌洗液、胸腔积液、尿液、痰液等)及临床信息进行管理,实现临床研究中心、各分中心及协作单位之间的信息化公开和资源共享。并加强与国际上呼吸系统疾病生物样本库的联系,建立国际标准化的呼吸系统疾病生物样本库资源共享平台(图1)。
2共享平台的简介
构建共享平台,致力于打造全国乃至全球呼吸疾病领域最全面、可共享的整合体系之一,促进样本资源的合理利用。平台的注册域名为